Organisation

A partir de 2008, les plateformes de génétique moléculaire des cancers en France ont été sollicitées pour l'analyse de mutations dans plusieurs tumeurs solides (poumon, côlon, mélanome, ovaire). Les missions se sont étendues depuis sur plusieurs marqueurs.

Depuis 2012, le projet national Gen&Tiss, initié par l'Institut National du Cancer (INCa) a pour objet l'évaluation externe de la qualité (EEQ) des examens de génétique moléculaire sur tissus tumoraux. Gen&Tiss permet une comparaison nationale inter-laboratoires. Dans une démarche d'amélioration continue des pratiques, des recommandations techniques et organisationnelles seront élaborées sur la base des résultats de ce contrôle.

Dans le cadre de l'accréditation ISO 15189, le programme Gen&Tiss permet aux laboratoires de justifier d'un contrôle qualité externe obligatoire pour accréditer les analyses réalisées.

Plusieurs structures sont impliquées dans l'organisation du programme Gen&Tiss :

Association Française d'Assurance Qualité en Anatomie et Cytologie Pathologiques (AFAQAP)
Expérience : organisme de contrôles de qualité en anatomopathologie.
Missions dans le projet :
- missions administratives : gestion administrative et financière, gestion de l'anonymat, gestion du site Internet
- missions techniques : préparation et envoi des lots aux participants.

Groupe Francophone de Cytogénomique Oncologique (GFCO)
Expérience : association professionnelle destinée à promouvoir l'expertise en génétique somatique.
Mission dans le projet : coordination du projet.

Gustave Roussy
Expérience : laboratoire de référence impliqué dans des programmes nationaux et internationaux de médecine personnalisée disposant d'une plateforme de séquençage haut débit dédiée au diagnostic.
Mission dans le projet : validation du statut moléculaire dans les échantillons.

Université Catholique de Louvain
Expérience : organisation de contrôles de qualité européens en génétique constitutionnelle et somatique.
Mission dans le projet : collecte et analyse des réponses des participants. Interprétation et diffusion des résultats du contrôle qualité.

Plateformes partenaires
Expérience : expertise en biologie moléculaire, expertise en anatomie pathologique.
Mission dans le projet : vérification du statut moléculaire, fourniture des échantillons primaires paraffinés, participation au comité de pilotage.

Laboratoire de l'Université Radboud de Nimègue (Pays-Bas)
Expérience : expertise en biologie moléculaire.
Mission dans le projet : vérification externe des échantillons de référence et liaison avec les programmes européens.

Comité de pilotage - Plateformes partenaires :

Plateforme de Génétique Moléculaire des Cancers, services d'Anatomie Pathologique et de Génétique Moléculaire et d'Histocompatibilité, CHRU de Brest
Pr Cédric LE MARECHAL, Dr Laurent DOUCET

Laboratoire de génétique somatique des tumeurs - Service de Pathologie, CHU de Rouen
Pr Jean-Christophe SABOURIN, Dr Aude LAMY

Département de Biopathologie, Unité de pathologique moléculaire; Centre Jean-Perrin - Clermont-Ferrand
Pr Frédérique PENAULT-LLORCA, Dr Cécile AUBE

Laboratoire de Pathologie Clinique et Expérimentale, UF2711, Hôpital Pasteur, CHU de Nice
Pr Paul HOFMAN, Dr Elodie LONG, Dr Véronique HOFMAN

Plate-forme de biopathologie des tumeurs - service de biochimie et oncogénétique - Paul Brousse - GH des hôpitaux universitaires Paris Sud/APHP - Villejuif
Pr Antoinette LEMOINE

Département de Pathologie ; Hôpital Cochin - Paris
Pr Karen LEROY, Dr Marie-Luce AURIAULT

Service de Pathologie, Hôpital Ambroise Paré, AP-HP - Boulogne
Pr Jean-François EMILE

Service de Pathologie, Hôpital Tenon, AP-HP - Boulogne
Dr Jean-François COTE

Hôpital Européen Georges Pompidou; Pôle Biologie; Service de biochimie - Paris
Dr Hélène BLONS, Pr Pierre LAURENT-PUIG

Institut Bergonié, Unité de pathologie moléculaire - Bordeaux
Dr Isabelle SOUBEYRAN

Laboratoire de génétique des tumeurs solides, CHU de Nice
Dr Florence PEDEUTOUR, Mme Valérie DURANTON-TANNEUR, Dr Valérie KUBINIEK

Plateforme de Biologie Moléculaire des Cancers de la Région Nord - Pas de Calais, Laboratoire de biochimie-biologie moléculaire; CHRU de Lille
Dr Farid ZERIMECH, Dr Clotilde DESCARPENTRIES

Laboratoire de Biologie Moléculaire, Département de Biopathologie, Centre Léon Bérard - Lyon
Dr Véronique HADDAD